L'Université fédérale de Sibérie met en œuvre des programmes éducatifs des niveaux suivants:
- l'enseignement secondaire professionnel
- formation professionnelle complémentaire
- l'enseignement supérieur (licence, spécialisation, master)
- formation de personnel hautement qualifié
L'université met en œuvre des formes d'enseignement à temps plein, à temps demi-partiel et à temps partiel.
Les durées d'études normatives sont : pour les programmes de licence - 4 ans pour l'enseignement à temps plein, 5 ans pour la formation à temps demi-partiel et à temps partiel ; pour les programmes de spécialisation - 5 ans ou 6 ans pour la formation à temps plein (conformément à la norme fédérale d'enseignement supérieur de l'État), 6 ans pour l'enseignement à temps demi-partiel et à temps partiel; pour les programmes de master - 2 ans pour la formation à temps plein, 2 ans 3 mois - 2 ans 6 mois pour la formation à temps demi-partiel et à temps partiel; pour les programmes de troisième cycle, selon la direction scientifique - enseignement à temps plein est de 3 ou 4 ans, enseignement à temps partiel - de 4 ou 5 ans.